ペンギン愛！長崎ペンギン水族館

館内は「長崎の海」やクラゲ水槽、大水槽をめぐる回遊動線。見どころは、世界に18種いるうち9種を一度に観察できる点で、コガタペンギン（フェアリー）からオウサマまで個性豊かな生態を比較できます。展示は学術拠点と連携した解説が充実しています。
「自然と人の共生」をテーマにペンギンをとおして、自然環境との共生について学ぶことができます。

自然体験ゾーンの小川、池、湿地、森、草地、海浜の中では、昆虫や魚介類、植物など多様な生き物を観察でき、自然界の食物連鎖環境のなかで、必死に生きる生き物について学べます。

イベントは毎日実施の「ペンギンのお食事タイム」やショー解説のほか、潮位次第で自然海岸を歩く「ふれあいペンギンビーチ」、バックヤードツアーなど体験系も人気（天候や生体により変更）。夏や花火開催日などは夜間延長営業があり、夕景の海とペンギンの共演が楽しめます。